"뇌종양의 원인도 다른 장기의 종양과 같이 확실하지 않아 뇌종양이 왜 생기는지는 아직 분명하지 않다."

일부 뇌종양에서는 화학적 발암 물질, 방사선, 바이러스등과 같은 환경적 요인과 신경섬유종과 같은 선천적인 염색체 - 유전성 증후군, 감염, 과거병력, 두부 외상, 약물 복용, 음주, 흡연등의 환자측 원인이 관련이 있다고 제시되거나 최근에는 전자파 등에 의한 가능성도 제기되고 있지만, 대부분의 뇌종양은 명확한 발생 원인을 모르는 경우가 많아서, 아직까지는 뇌종양에 걸릴 것을 예측하여 뇌종양이 생기지 않도록 예방하는 것은 불가능하다.

최근 급속히 발전중인 뇌종양에 대한 분자유전학 및 분자생물학적 연구의 결과로 뇌종양이 종양유전자의 증폭과 종양억제유전자의 결손과 관계가 있다고 알려지고 있으며 종양 세포의 성장을 조절하는 단백질, 종양 세포가 죽는 과정, 종양이 주변조직으로 파고 들어가게 하는 효소, 종양이 자라도록 촉진하는 혈관 신생등에 관한 비밀이 많이 밝혀지고 있다.